期刊简介
《医学临床研究》由湖南省卫生厅主管、湖南省医学会主办，经国家新闻出版总署批准（中国连续出版物号ISSN1671-7171，CN43-1382/R）的医学临床类科技期刊。原名《湖南医学》，1984年10月创刊，由我国著名医学专家柳用墨教授任主编，1985年2月正式出版发行，2002年更名为《医学临床研究》由双月刊改为月刊。20多年来，本刊先后获得国家、省级一级一类优秀科技期刊奖多项，2000年入选中国期刊方阵（双效期刊），2002年4月再进入科技部中国科技论文统计源期刊，入编《中国学术期刊光盘版》，被万方数据库全文收录。本刊的宗旨是：注重学术，讲求质量，力创精品，为医学临床事业和广大科技工作者服务。设有论著、临床研究（含药物与临床、检验与临床、医学影像、麻醉等）、诊疗经验、护理园地、病例报告、医院管理等常规栏目，间有院士（专家）论坛、院长笔谈、述评及专题论述等特色栏目。目前稿源已涉及全国各省、市（区）及香港特区。 《医学临床研究》为月刊，每月26日出版，大16开本，192页，铜板纸印刷，每期定价15.00元，全年12期，国内外公开发行，邮发代号42-13，全国各地邮局均可订阅，编辑部亦可办理邮购。邮局汇款：湖南省长沙市湘雅路30号（省卫生厅内）医学临床研究杂志社，邮编410008。银行汇款：开户名称：医学临床研究杂志社开户银行：中国银行长沙市湘雅支行开户账号：610657349900Email:jcr_cs.hn@vip.163.com网址： http://www.jcr.net.cn联系电话（传真）：0731-84824007。
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首页>医学临床研究杂志
- 杂志名称：医学临床研究杂志
- 主管单位：湖南省卫生厅
- 主办单位：中华医学会湖南分会
- 国际刊号：1671-7171
- 国内刊号：43-1382/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国国家期刊方阵期刊期刊收录：CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中)
基于表达谱芯片技术的食管鳞状细胞癌相关差异基因的筛选及功能研究
项捷；车嘉铭；陈凯；杭钧彪
关键词：基因表达, 遗传学技术, 癌, 鳞状细胞, 食管肿瘤
摘要：目的利用食管鳞状细胞癌细胞相关基因芯片数据，筛选与食管癌显著相关的关键基因，并对关键基因所在的模块进行功能研究。方法从基因表达数据库 GEO 数据库中下载数据 GSE17351(数据共10个样本，正常和食管鳞状细胞癌样本组织各5个)，利用 R软件包做数据预处理和差异表达分析，选取差异表达基因(FDR <0.05及差异值>2或<-2)。然后对差异表达基因进行生物信息学分析，首先投入 String 在线分析工具获得差异表达基因的蛋白-蛋白相互作用网络(score>0.9)，统计网络中各个节点的度，挑选出关键的主效基因(hub基因)。然后利用Cytoscape软件插件 Mcode对整个网络进行网络模块化，并通过插件Bingo(P value<0.05)对hub基因所在的模块进行功能注释，推测模块中影响基因特异性表达导致食管癌的机制和方式。结果通过比较正常和患病者食管鳞状细胞癌表达数据，筛选到600个差异表达的基因，构建了包含268对差异表达基因产物蛋白对的相互作用网络。找到关键 hub 基因 TOP2A。得到1个包括hub基因在内由5个差异表达基因组成的模块，模块功能显著富集在染色体分离和浓缩；发现与多种癌症相关的基因TOP2A共同起染色体活动基因 NCAPG。结论食管鳞癌的发生与关键基因 TOP2A的异常表达有关，推测与之功能发生作用的基因 NCAPG 基因通过与 TOP2A 相同的机制和方式(染色体中前期活动)影响着癌症特异性基因的表达。
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